Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms