Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3tc1G3X9F6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3tc1G3X9F6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3tc1G3X9F6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3tc1G3X9F6 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3tc1G3X9F6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3tc1G3X9F6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3tc1G3X9F6 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3tc1G3X9F6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh3tc1G3X9F6 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms