Protein–RNA interactions for Protein: G3UW87

Gm17455, MCG55969, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17455G3UW87 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm17455G3UW87 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm17455G3UW87 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm17455G3UW87 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm17455G3UW87 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm17455G3UW87 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm17455G3UW87 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm17455G3UW87 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm17455G3UW87 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm17455G3UW87 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm17455G3UW87 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17455G3UW87 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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