Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp32F8VPZ3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp32F8VPZ3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms