Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm17555F6U8B9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm17555F6U8B9 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm17555F6U8B9 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm17555F6U8B9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm17555F6U8B9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm17555F6U8B9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm17555F6U8B9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm17555F6U8B9 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm17555F6U8B9 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm17555F6U8B9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm17555F6U8B9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm17555F6U8B9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm17555F6U8B9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm17555F6U8B9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm17555F6U8B9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm17555F6U8B9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm17555F6U8B9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms