Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo5cE9Q1F5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms