Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gcn1E9PVA8 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms