Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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