Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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BC048679D3YXE9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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BC048679D3YXE9 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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BC048679D3YXE9 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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BC048679D3YXE9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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BC048679D3YXE9 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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BC048679D3YXE9 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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BC048679D3YXE9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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BC048679D3YXE9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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