Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Phf11cB4XVP9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11cB4XVP9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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