Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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Znf518bB2RRE4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf518bB2RRE4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Znf518bB2RRE4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf518bB2RRE4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Znf518bB2RRE4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Znf518bB2RRE4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf518bB2RRE4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Znf518bB2RRE4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf518bB2RRE4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Znf518bB2RRE4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Znf518bB2RRE4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Znf518bB2RRE4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf518bB2RRE4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf518bB2RRE4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf518bB2RRE4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf518bB2RRE4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf518bB2RRE4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf518bB2RRE4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf518bB2RRE4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf518bB2RRE4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf518bB2RRE4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf518bB2RRE4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf518bB2RRE4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms