Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf1bp1B2KF50 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms