Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms