Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik3B1AS29 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms