Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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PtprsB0V2N1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PtprsB0V2N1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PtprsB0V2N1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PtprsB0V2N1 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PtprsB0V2N1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PtprsB0V2N1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprsB0V2N1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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