Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms