Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ccdc183A2AJB1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ccdc183A2AJB1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms