Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Top3bQ9Z321 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Top3bQ9Z321 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Top3bQ9Z321 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Top3bQ9Z321 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Top3bQ9Z321 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Top3bQ9Z321 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Top3bQ9Z321 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Top3bQ9Z321 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms