Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Robo3Q9Z2I4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms