Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Pfdn5Q9WU28 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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