Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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