Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Col4a3Q9QZS0 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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