Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Hacd1Q9QY80 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Hacd1Q9QY80 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hacd1Q9QY80 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hacd1Q9QY80 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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