Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms