Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Snai3Q9QY31 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms