Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Homer2Q9QWW1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Homer2Q9QWW1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Homer2Q9QWW1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Homer2Q9QWW1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Homer2Q9QWW1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Homer2Q9QWW1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Homer2Q9QWW1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Homer2Q9QWW1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Homer2Q9QWW1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Homer2Q9QWW1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Homer2Q9QWW1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Homer2Q9QWW1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Homer2Q9QWW1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms