Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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