Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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