Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms