Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Arl6ip1Q9JKW0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms