Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms