Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms