Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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