Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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