Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim54Q9ERP3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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