Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tlnrd1Q9ERE8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms