Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rhox9Q9EQM5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhox9Q9EQM5 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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