Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ccdc97Q9DBT3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ccdc97Q9DBT3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ccdc97Q9DBT3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ccdc97Q9DBT3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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