Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms