Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rnf138rt1Q9D9M9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Rnf138rt1Q9D9M9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Rnf138rt1Q9D9M9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Rnf138rt1Q9D9M9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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