Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms