Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrameQ9D4Z5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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