Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms