Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms