Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Snx29Q9D3S3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Snx29Q9D3S3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Snx29Q9D3S3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Snx29Q9D3S3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Snx29Q9D3S3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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