Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Krt20Q9D312 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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