Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms