Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snf8Q9CZ28 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snf8Q9CZ28 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snf8Q9CZ28 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snf8Q9CZ28 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snf8Q9CZ28 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Snf8Q9CZ28 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snf8Q9CZ28 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Snf8Q9CZ28 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snf8Q9CZ28 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snf8Q9CZ28 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snf8Q9CZ28 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Snf8Q9CZ28 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms