Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Sgo1Q9CXH7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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Sgo1Q9CXH7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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