Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms